Bên cạnh những kết quả đạt được, công tác triển khai, thực hiện vẫn còn nổi lên một số tồn tại đó là: công tác tuyên truyền, vận động trong các doanh nghiệp còn gặp nhiều khó khăn; hoạt động phối hợp giữa các đơn vị, tổ chức thành viên, giữa đơn vị thành viên với cấp ủy, chính quyền xã, thị trấn (nơi có doanh nghiệp) chưa thật sự nhịp nhàng, công tác phổ biến các chủ trương, chính sách của Đảng và pháp luật của Nhà nước chưa thật sự đồng bộ và thống nhất; việc nuôi dưỡng phong trào, hoạt động của các tổ chức đoàn thể đã được thành lập trong doanh nghiệp còn nhiều khó khăn.
Với những hạn chế, tồn tại nêu trên là do nhiều nguyên nhân khác nhau; nhưng chủ yếu tập trung ở một số nguyên nhân khách quan và chủ quan sau đây: Trong lãnh đạo, chỉ đạo có mặt, có việc chưa thật sự quyết liệt và thường xuyên, hoạt động của các ngành liên quan và các tổ chức thành viên của Ban Chỉ đạo huyện còn nặng về công tác chuyên môn, ít giành thời gian cho công tác này. Các doanh nghiệp trên địa bàn huyện chủ yếu là nhỏ và siêu nhỏ, hoạt động kinh doanh chủ yếu là thương mại, dịch vụ ăn uống, mua và xuất khẩu thanh long... nên lực lượng lao động ít, lại thường xuyên biến động, hoạt động kinh doanh mang tính thời vụ (theo mùa), khó quản lý, vận động; các công ty du lịch chủ yếu do tỉnh quản lý nên việc liên hệ làm việc khó khăn... Bên cạnh đó, ảnh hưởng của sự suy thoái kinh tế, giá cả trái cây thanh long bấp bênh, không ổn định; hơn nữa trong những năm gần đây đã có nhiều thương lái người Trung Quốc thâu tóm gần như toàn bộ hoạt động mua bán thanh long, nhiều vựa thu mua thanh long ở huyện ngưng hoạt động hoặc cho thuê, sang nhượng hay đi làm công cho người Trung Quốc gây khó khăn cho việc tiếp cận xây dựng tổ chức đảng, đoàn thể.
Để làm tốt công tác xây dựng Đảng, các đoàn thể nhân dân trong doanh nghiệp ngoài khu vực Nhà nước ở huyện năm 2017 và những năm tiếp theo, đòi hỏi các cấp, các ngành trong hệ thống chính trị từ huyện đến cơ sở cần triển khai, thực hiện tốt một số nhiệm vụ, giải pháp sau đây:
-Tiếp tục triển khai, quán triệt các văn bản của Trung ương, của tỉnh, của huyện có liên quan đến công tác xây dựng Đảng, các đoàn thể nhân dân trong các doanh nghiệp tư nhân và doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài; nhất là Nghị định 98/2014/NĐ-CP ngày 24/10/2014 của Chính phủ; Thông báo số 193-TB/HU, ngày 13/9/2016 của Ban Thường vụ Huyện ủy về kết luận Hội nghị sơ kết việc thực hiện Kết luận số 80-KL/TW của Ban Bí thư Trung ương Đảng
-Căn cứ Chương trình công tác hàng năm của Ban Chỉ đạo tỉnh để tiến hành xây dựng, ban hành và triển khai, thực hiện chương trình, kế hoạch của Ban Chỉ đạo huyện thật sự đạt hiệu quả; trong đó chú ý tập trung vận động các chủ doanh nghiệp tạo sự đồng thuận trong việc thành lập các tổ chức đoàn thể khi có đủ điều kiện.
-Các tổ chức thành viên Ban Chỉ đạo huyện tiếp tục đẩy mạnh công tác khảo sát, đánh giá tình hình, quy mô của doanh nghiệp, tình hình lao động; số lượng lao động, công tác trong các doanh nghiệp để có giải pháp vận động thành lập tổ chức cho phù hợp. Kể cả khảo sát tình hình đảng viên đang sinh hoạt tại các Chi bộ thôn, khu phố, nhưng làm việc trong các doanh nghiệp trên địa bàn huyện.
-Tham mưu cấp ủy chỉ đạo các tổ chức Đảng, nhất là các xã, thị trấn có lao động người địa phương đang lao động ở các doanh nghiệp đóng trên địa bàn để vận động, tạo nguồn, bồi dưỡng phát triển đảng viên mới; gắn với phát triển thí điểm đảng viên là chủ doanh nghiệp.
-Các tổ chức đoàn thể cấp huyện phải quan tâm hơn nữa trong việc đẩy mạnh các phong trào, hoạt động để nuôi dưỡng, tạo điều kiện duy trì và nâng cao chất lượng hoạt động trong các tổ chức đoàn thể đã được thành lập trong các doanh nghiệp; đồng thời thực hiện tốt công tác củng cố tổ chức, tạo nguồn và phát triển đoàn viên, hội viên mới.
-Ban Chỉ đạo huyện phải xây dựng, ban hành kế hoạch hàng năm thật cụ thể, giao chỉ tiêu cho các tổ chức thành viên trong việc vận động phát triển Đảng và các tổ chức đoàn thể trong doanh nghiệp ngoài khu vực nhà nước.